Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab33bO35963 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab33bO35963 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab33bO35963 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab33bO35963 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab33bO35963 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab33bO35963 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab33bO35963 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab33bO35963 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab33bO35963 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab33bO35963 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rab33bO35963 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab33bO35963 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab33bO35963 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab33bO35963 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab33bO35963 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab33bO35963 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab33bO35963 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab33bO35963 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab33bO35963 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab33bO35963 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab33bO35963 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab33bO35963 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab33bO35963 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab33bO35963 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab33bO35963 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab33bO35963 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab33bO35963 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab33bO35963 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab33bO35963 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab33bO35963 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab33bO35963 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab33bO35963 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab33bO35963 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab33bO35963 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab33bO35963 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab33bO35963 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab33bO35963 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab33bO35963 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab33bO35963 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab33bO35963 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab33bO35963 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab33bO35963 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab33bO35963 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab33bO35963 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab33bO35963 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab33bO35963 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab33bO35963 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab33bO35963 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab33bO35963 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab33bO35963 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab33bO35963 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab33bO35963 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab33bO35963 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab33bO35963 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab33bO35963 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab33bO35963 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab33bO35963 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab33bO35963 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab33bO35963 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab33bO35963 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab33bO35963 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms