Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cited2O35740 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cited2O35740 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cited2O35740 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cited2O35740 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cited2O35740 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cited2O35740 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cited2O35740 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cited2O35740 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cited2O35740 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cited2O35740 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cited2O35740 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cited2O35740 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cited2O35740 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cited2O35740 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cited2O35740 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cited2O35740 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cited2O35740 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cited2O35740 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cited2O35740 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cited2O35740 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cited2O35740 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cited2O35740 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cited2O35740 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cited2O35740 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cited2O35740 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cited2O35740 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cited2O35740 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cited2O35740 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cited2O35740 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cited2O35740 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cited2O35740 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cited2O35740 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cited2O35740 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cited2O35740 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cited2O35740 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cited2O35740 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cited2O35740 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cited2O35740 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cited2O35740 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cited2O35740 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cited2O35740 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cited2O35740 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cited2O35740 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cited2O35740 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cited2O35740 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cited2O35740 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cited2O35740 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cited2O35740 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cited2O35740 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cited2O35740 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cited2O35740 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cited2O35740 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cited2O35740 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cited2O35740 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cited2O35740 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cited2O35740 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cited2O35740 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cited2O35740 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cited2O35740 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cited2O35740 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cited2O35740 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cited2O35740 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cited2O35740 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cited2O35740 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cited2O35740 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Cited2O35740 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cited2O35740 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cited2O35740 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cited2O35740 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cited2O35740 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cited2O35740 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cited2O35740 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cited2O35740 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cited2O35740 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Cited2O35740 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cited2O35740 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cited2O35740 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms