Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capn6O35646 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Capn6O35646 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capn6O35646 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capn6O35646 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Capn6O35646 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn6O35646 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn6O35646 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn6O35646 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn6O35646 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn6O35646 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn6O35646 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn6O35646 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn6O35646 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn6O35646 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn6O35646 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn6O35646 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn6O35646 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn6O35646 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn6O35646 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn6O35646 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn6O35646 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn6O35646 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn6O35646 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn6O35646 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn6O35646 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn6O35646 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn6O35646 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn6O35646 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn6O35646 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn6O35646 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Capn6O35646 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn6O35646 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Capn6O35646 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capn6O35646 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capn6O35646 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capn6O35646 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn6O35646 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn6O35646 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn6O35646 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn6O35646 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn6O35646 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn6O35646 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capn6O35646 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capn6O35646 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capn6O35646 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capn6O35646 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capn6O35646 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn6O35646 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn6O35646 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn6O35646 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn6O35646 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn6O35646 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn6O35646 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Capn6O35646 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Capn6O35646 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Capn6O35646 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Capn6O35646 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Capn6O35646 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capn6O35646 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn6O35646 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn6O35646 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn6O35646 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn6O35646 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn6O35646 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn6O35646 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn6O35646 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn6O35646 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn6O35646 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn6O35646 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Capn6O35646 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Capn6O35646 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn6O35646 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn6O35646 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capn6O35646 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn6O35646 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn6O35646 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn6O35646 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn6O35646 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn6O35646 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn6O35646 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn6O35646 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn6O35646 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capn6O35646 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capn6O35646 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capn6O35646 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capn6O35646 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Capn6O35646 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capn6O35646 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capn6O35646 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Capn6O35646 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Capn6O35646 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capn6O35646 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capn6O35646 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capn6O35646 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capn6O35646 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capn6O35646 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capn6O35646 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Capn6O35646 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Capn6O35646 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115 ms