Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Foxd2O35392 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Foxd2O35392 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Foxd2O35392 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxd2O35392 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxd2O35392 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxd2O35392 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxd2O35392 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxd2O35392 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxd2O35392 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxd2O35392 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxd2O35392 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxd2O35392 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxd2O35392 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxd2O35392 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxd2O35392 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxd2O35392 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxd2O35392 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Foxd2O35392 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Foxd2O35392 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxd2O35392 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxd2O35392 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxd2O35392 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Foxd2O35392 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxd2O35392 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxd2O35392 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxd2O35392 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxd2O35392 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxd2O35392 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxd2O35392 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxd2O35392 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxd2O35392 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Foxd2O35392 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxd2O35392 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxd2O35392 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxd2O35392 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxd2O35392 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxd2O35392 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxd2O35392 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxd2O35392 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxd2O35392 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Foxd2O35392 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Foxd2O35392 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Foxd2O35392 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxd2O35392 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxd2O35392 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxd2O35392 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Foxd2O35392 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxd2O35392 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxd2O35392 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxd2O35392 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxd2O35392 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxd2O35392 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxd2O35392 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxd2O35392 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxd2O35392 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxd2O35392 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxd2O35392 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Foxd2O35392 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Foxd2O35392 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxd2O35392 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxd2O35392 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxd2O35392 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxd2O35392 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxd2O35392 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxd2O35392 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxd2O35392 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxd2O35392 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Foxd2O35392 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxd2O35392 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxd2O35392 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Foxd2O35392 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxd2O35392 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxd2O35392 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxd2O35392 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxd2O35392 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxd2O35392 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Foxd2O35392 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Foxd2O35392 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Foxd2O35392 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Foxd2O35392 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Foxd2O35392 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxd2O35392 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxd2O35392 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxd2O35392 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxd2O35392 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Foxd2O35392 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Foxd2O35392 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Foxd2O35392 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxd2O35392 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxd2O35392 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxd2O35392 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxd2O35392 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxd2O35392 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxd2O35392 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxd2O35392 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxd2O35392 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxd2O35392 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxd2O35392 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxd2O35392 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms