Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms