Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CckarO08786 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CckarO08786 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CckarO08786 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CckarO08786 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CckarO08786 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CckarO08786 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CckarO08786 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CckarO08786 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CckarO08786 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CckarO08786 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CckarO08786 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CckarO08786 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CckarO08786 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CckarO08786 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CckarO08786 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CckarO08786 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CckarO08786 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CckarO08786 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CckarO08786 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CckarO08786 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CckarO08786 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CckarO08786 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CckarO08786 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CckarO08786 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CckarO08786 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CckarO08786 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CckarO08786 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CckarO08786 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CckarO08786 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CckarO08786 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CckarO08786 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CckarO08786 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CckarO08786 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CckarO08786 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CckarO08786 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CckarO08786 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CckarO08786 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CckarO08786 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CckarO08786 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CckarO08786 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CckarO08786 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CckarO08786 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CckarO08786 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CckarO08786 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CckarO08786 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CckarO08786 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CckarO08786 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CckarO08786 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CckarO08786 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CckarO08786 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CckarO08786 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CckarO08786 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CckarO08786 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CckarO08786 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CckarO08786 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CckarO08786 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CckarO08786 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CckarO08786 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CckarO08786 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CckarO08786 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CckarO08786 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CckarO08786 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CckarO08786 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CckarO08786 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CckarO08786 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CckarO08786 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CckarO08786 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CckarO08786 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CckarO08786 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CckarO08786 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CckarO08786 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CckarO08786 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CckarO08786 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CckarO08786 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CckarO08786 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CckarO08786 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CckarO08786 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CckarO08786 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CckarO08786 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CckarO08786 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CckarO08786 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CckarO08786 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CckarO08786 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CckarO08786 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CckarO08786 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CckarO08786 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CckarO08786 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CckarO08786 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CckarO08786 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CckarO08786 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CckarO08786 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CckarO08786 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CckarO08786 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CckarO08786 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CckarO08786 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CckarO08786 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CckarO08786 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CckarO08786 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CckarO08786 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms