Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm9602J3QPD5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm9602J3QPD5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm9602J3QPD5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm9602J3QPD5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm9602J3QPD5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm9602J3QPD5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm9602J3QPD5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm9602J3QPD5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm9602J3QPD5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm9602J3QPD5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm9602J3QPD5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm9602J3QPD5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm9602J3QPD5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm9602J3QPD5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm9602J3QPD5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm9602J3QPD5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm9602J3QPD5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm9602J3QPD5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm9602J3QPD5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm9602J3QPD5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm9602J3QPD5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm9602J3QPD5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm9602J3QPD5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm9602J3QPD5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm9602J3QPD5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm9602J3QPD5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm9602J3QPD5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm9602J3QPD5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm9602J3QPD5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm9602J3QPD5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm9602J3QPD5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm9602J3QPD5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms