Protein–RNA interactions for Protein: F7CD45

Gm8334, Predicted gene 8334, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8334F7CD45 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm8334F7CD45 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm8334F7CD45 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm8334F7CD45 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm8334F7CD45 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm8334F7CD45 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm8334F7CD45 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm8334F7CD45 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm8334F7CD45 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm8334F7CD45 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm8334F7CD45 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm8334F7CD45 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm8334F7CD45 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm8334F7CD45 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm8334F7CD45 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm8334F7CD45 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gm8334F7CD45 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm8334F7CD45 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm8334F7CD45 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm8334F7CD45 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm8334F7CD45 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm8334F7CD45 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm8334F7CD45 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm8334F7CD45 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm8334F7CD45 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm8334F7CD45 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm8334F7CD45 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm8334F7CD45 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm8334F7CD45 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm8334F7CD45 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm8334F7CD45 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm8334F7CD45 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm8334F7CD45 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm8334F7CD45 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm8334F7CD45 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm8334F7CD45 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm8334F7CD45 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm8334F7CD45 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm8334F7CD45 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm8334F7CD45 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm8334F7CD45 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm8334F7CD45 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm8334F7CD45 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm8334F7CD45 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm8334F7CD45 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm8334F7CD45 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm8334F7CD45 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm8334F7CD45 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm8334F7CD45 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm8334F7CD45 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm8334F7CD45 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm8334F7CD45 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm8334F7CD45 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm8334F7CD45 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm8334F7CD45 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm8334F7CD45 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm8334F7CD45 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm8334F7CD45 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm8334F7CD45 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm8334F7CD45 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm8334F7CD45 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm8334F7CD45 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm8334F7CD45 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm8334F7CD45 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm8334F7CD45 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm8334F7CD45 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm8334F7CD45 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm8334F7CD45 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm8334F7CD45 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm8334F7CD45 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm8334F7CD45 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm8334F7CD45 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm8334F7CD45 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm8334F7CD45 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm8334F7CD45 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm8334F7CD45 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm8334F7CD45 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm8334F7CD45 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm8334F7CD45 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm8334F7CD45 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm8334F7CD45 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm8334F7CD45 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm8334F7CD45 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm8334F7CD45 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm8334F7CD45 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm8334F7CD45 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm8334F7CD45 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm8334F7CD45 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm8334F7CD45 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm8334F7CD45 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm8334F7CD45 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm8334F7CD45 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm8334F7CD45 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm8334F7CD45 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm8334F7CD45 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm8334F7CD45 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm8334F7CD45 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm8334F7CD45 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm8334F7CD45 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm8334F7CD45 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms