Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igkv1-99F6XWB2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igkv1-99F6XWB2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igkv1-99F6XWB2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igkv1-99F6XWB2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igkv1-99F6XWB2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igkv1-99F6XWB2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igkv1-99F6XWB2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Igkv1-99F6XWB2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igkv1-99F6XWB2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Igkv1-99F6XWB2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igkv1-99F6XWB2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igkv1-99F6XWB2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igkv1-99F6XWB2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igkv1-99F6XWB2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igkv1-99F6XWB2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igkv1-99F6XWB2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Igkv1-99F6XWB2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Igkv1-99F6XWB2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igkv1-99F6XWB2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igkv1-99F6XWB2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igkv1-99F6XWB2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igkv1-99F6XWB2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igkv1-99F6XWB2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igkv1-99F6XWB2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igkv1-99F6XWB2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igkv1-99F6XWB2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igkv1-99F6XWB2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igkv1-99F6XWB2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igkv1-99F6XWB2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igkv1-99F6XWB2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igkv1-99F6XWB2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igkv1-99F6XWB2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igkv1-99F6XWB2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Igkv1-99F6XWB2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Igkv1-99F6XWB2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms