Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Erich3F6QRE9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Erich3F6QRE9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Erich3F6QRE9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
Erich3F6QRE9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,44■■■■□ 3,9
Erich3F6QRE9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,43■■■■□ 3,9
Erich3F6QRE9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,42■■■■□ 3,9
Erich3F6QRE9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,41■■■■□ 3,9
Erich3F6QRE9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
Erich3F6QRE9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC39,4■■■■□ 3,9
Erich3F6QRE9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
Erich3F6QRE9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC39,39■■■■□ 3,9
Erich3F6QRE9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,38■■■■□ 3,9
Erich3F6QRE9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,38■■■■□ 3,89
Erich3F6QRE9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC39,37■■■■□ 3,89
Erich3F6QRE9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC39,36■■■■□ 3,89
Erich3F6QRE9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,35■■■■□ 3,89
Erich3F6QRE9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC39,34■■■■□ 3,89
Erich3F6QRE9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,33■■■■□ 3,89
Erich3F6QRE9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,31■■■■□ 3,88
Erich3F6QRE9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,31■■■■□ 3,88
Erich3F6QRE9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC39,3■■■■□ 3,88
Erich3F6QRE9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,3■■■■□ 3,88
Erich3F6QRE9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,3■■■■□ 3,88
Erich3F6QRE9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
Erich3F6QRE9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,26■■■■□ 3,88
Erich3F6QRE9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC39,26■■■■□ 3,88
Erich3F6QRE9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39,26■■■■□ 3,87
Erich3F6QRE9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC39,23■■■■□ 3,87
Erich3F6QRE9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39,23■■■■□ 3,87
Erich3F6QRE9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,22■■■■□ 3,87
Erich3F6QRE9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,22■■■■□ 3,87
Erich3F6QRE9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
Erich3F6QRE9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
Erich3F6QRE9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39,19■■■■□ 3,86
Erich3F6QRE9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,18■■■■□ 3,86
Erich3F6QRE9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
Erich3F6QRE9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,15■■■■□ 3,86
Erich3F6QRE9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,14■■■■□ 3,86
Erich3F6QRE9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,14■■■■□ 3,86
Erich3F6QRE9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC39,14■■■■□ 3,86
Erich3F6QRE9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
Erich3F6QRE9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,09■■■■□ 3,85
Erich3F6QRE9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,09■■■■□ 3,85
Erich3F6QRE9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39,08■■■■□ 3,85
Erich3F6QRE9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,08■■■■□ 3,85
Erich3F6QRE9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,08■■■■□ 3,85
Erich3F6QRE9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,08■■■■□ 3,85
Erich3F6QRE9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,07■■■■□ 3,85
Erich3F6QRE9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC39,07■■■■□ 3,85
Erich3F6QRE9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,04■■■■□ 3,84
Erich3F6QRE9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,04■■■■□ 3,84
Erich3F6QRE9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,03■■■■□ 3,84
Erich3F6QRE9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC39,03■■■■□ 3,84
Erich3F6QRE9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC39,01■■■■□ 3,84
Erich3F6QRE9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Erich3F6QRE9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,98■■■■□ 3,83
Erich3F6QRE9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC38,97■■■■□ 3,83
Erich3F6QRE9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38,95■■■■□ 3,83
Erich3F6QRE9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38,94■■■■□ 3,82
Erich3F6QRE9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,92■■■■□ 3,82
Erich3F6QRE9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC38,92■■■■□ 3,82
Erich3F6QRE9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,92■■■■□ 3,82
Erich3F6QRE9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,89■■■■□ 3,82
Erich3F6QRE9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,88■■■■□ 3,81
Erich3F6QRE9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC38,86■■■■□ 3,81
Erich3F6QRE9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC38,86■■■■□ 3,81
Erich3F6QRE9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC38,85■■■■□ 3,81
Erich3F6QRE9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,85■■■■□ 3,81
Erich3F6QRE9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,85■■■■□ 3,81
Erich3F6QRE9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC38,81■■■■□ 3,8
Erich3F6QRE9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38,81■■■■□ 3,8
Erich3F6QRE9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC38,81■■■■□ 3,8
Erich3F6QRE9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38,81■■■■□ 3,8
Erich3F6QRE9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC38,79■■■■□ 3,8
Erich3F6QRE9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,79■■■■□ 3,8
Erich3F6QRE9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC38,78■■■■□ 3,8
Erich3F6QRE9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC38,78■■■■□ 3,8
Erich3F6QRE9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,77■■■■□ 3,8
Erich3F6QRE9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC38,76■■■■□ 3,8
Erich3F6QRE9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
Erich3F6QRE9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
Erich3F6QRE9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
Erich3F6QRE9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Erich3F6QRE9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Erich3F6QRE9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,71■■■■□ 3,79
Erich3F6QRE9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38,68■■■■□ 3,78
Erich3F6QRE9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC38,68■■■■□ 3,78
Erich3F6QRE9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,67■■■■□ 3,78
Erich3F6QRE9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC38,65■■■■□ 3,78
Erich3F6QRE9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38,65■■■■□ 3,78
Erich3F6QRE9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38,63■■■■□ 3,77
Erich3F6QRE9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC38,62■■■■□ 3,77
Erich3F6QRE9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC38,62■■■■□ 3,77
Erich3F6QRE9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
Erich3F6QRE9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38,59■■■■□ 3,77
Erich3F6QRE9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC38,59■■■■□ 3,77
Erich3F6QRE9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,59■■■■□ 3,77
Erich3F6QRE9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC38,58■■■■□ 3,77
Erich3F6QRE9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms