Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap46E9Q2C0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap46E9Q2C0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap46E9Q2C0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap46E9Q2C0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap46E9Q2C0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap46E9Q2C0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap46E9Q2C0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap46E9Q2C0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap46E9Q2C0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap46E9Q2C0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap46E9Q2C0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap46E9Q2C0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap46E9Q2C0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap46E9Q2C0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap46E9Q2C0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap46E9Q2C0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap46E9Q2C0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap46E9Q2C0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap46E9Q2C0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap46E9Q2C0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap46E9Q2C0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap46E9Q2C0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap46E9Q2C0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap46E9Q2C0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap46E9Q2C0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap46E9Q2C0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap46E9Q2C0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap46E9Q2C0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap46E9Q2C0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap46E9Q2C0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap46E9Q2C0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap46E9Q2C0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap46E9Q2C0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap46E9Q2C0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap46E9Q2C0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap46E9Q2C0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap46E9Q2C0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap46E9Q2C0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap46E9Q2C0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap46E9Q2C0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap46E9Q2C0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap46E9Q2C0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap46E9Q2C0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap46E9Q2C0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap46E9Q2C0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap46E9Q2C0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap46E9Q2C0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap46E9Q2C0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap46E9Q2C0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap46E9Q2C0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap46E9Q2C0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap46E9Q2C0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap46E9Q2C0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap46E9Q2C0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap46E9Q2C0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap46E9Q2C0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap46E9Q2C0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap46E9Q2C0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap46E9Q2C0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap46E9Q2C0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap46E9Q2C0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap46E9Q2C0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap46E9Q2C0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap46E9Q2C0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfap46E9Q2C0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfap46E9Q2C0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfap46E9Q2C0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfap46E9Q2C0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfap46E9Q2C0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap46E9Q2C0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap46E9Q2C0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap46E9Q2C0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap46E9Q2C0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap46E9Q2C0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap46E9Q2C0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap46E9Q2C0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap46E9Q2C0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap46E9Q2C0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap46E9Q2C0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap46E9Q2C0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfap46E9Q2C0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap46E9Q2C0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap46E9Q2C0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap46E9Q2C0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap46E9Q2C0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap46E9Q2C0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap46E9Q2C0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap46E9Q2C0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap46E9Q2C0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap46E9Q2C0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap46E9Q2C0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap46E9Q2C0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap46E9Q2C0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap46E9Q2C0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Cfap46E9Q2C0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap46E9Q2C0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap46E9Q2C0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap46E9Q2C0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap46E9Q2C0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms