Protein–RNA interactions for Protein: D3YVV3

Ankrd29, Ankyrin repeat domain 29, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd29D3YVV3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd29D3YVV3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd29D3YVV3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd29D3YVV3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd29D3YVV3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd29D3YVV3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ankrd29D3YVV3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd29D3YVV3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd29D3YVV3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd29D3YVV3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd29D3YVV3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd29D3YVV3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd29D3YVV3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd29D3YVV3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd29D3YVV3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd29D3YVV3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd29D3YVV3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd29D3YVV3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd29D3YVV3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd29D3YVV3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd29D3YVV3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd29D3YVV3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd29D3YVV3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd29D3YVV3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd29D3YVV3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ankrd29D3YVV3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd29D3YVV3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd29D3YVV3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd29D3YVV3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd29D3YVV3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd29D3YVV3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd29D3YVV3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd29D3YVV3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd29D3YVV3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd29D3YVV3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd29D3YVV3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd29D3YVV3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd29D3YVV3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ankrd29D3YVV3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd29D3YVV3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd29D3YVV3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd29D3YVV3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd29D3YVV3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd29D3YVV3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd29D3YVV3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd29D3YVV3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd29D3YVV3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd29D3YVV3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd29D3YVV3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd29D3YVV3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd29D3YVV3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd29D3YVV3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd29D3YVV3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd29D3YVV3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd29D3YVV3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd29D3YVV3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd29D3YVV3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd29D3YVV3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd29D3YVV3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd29D3YVV3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd29D3YVV3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd29D3YVV3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd29D3YVV3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd29D3YVV3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd29D3YVV3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd29D3YVV3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd29D3YVV3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd29D3YVV3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd29D3YVV3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd29D3YVV3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd29D3YVV3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd29D3YVV3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd29D3YVV3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ankrd29D3YVV3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ankrd29D3YVV3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ankrd29D3YVV3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ankrd29D3YVV3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ankrd29D3YVV3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ankrd29D3YVV3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ankrd29D3YVV3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ankrd29D3YVV3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ankrd29D3YVV3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ankrd29D3YVV3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ankrd29D3YVV3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ankrd29D3YVV3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ankrd29D3YVV3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ankrd29D3YVV3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ankrd29D3YVV3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ankrd29D3YVV3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ankrd29D3YVV3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ankrd29D3YVV3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ankrd29D3YVV3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ankrd29D3YVV3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ankrd29D3YVV3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd29D3YVV3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd29D3YVV3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd29D3YVV3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ankrd29D3YVV3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd29D3YVV3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ankrd29D3YVV3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms