Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ism1A2ATD1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ism1A2ATD1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ism1A2ATD1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ism1A2ATD1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ism1A2ATD1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ism1A2ATD1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ism1A2ATD1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ism1A2ATD1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ism1A2ATD1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ism1A2ATD1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ism1A2ATD1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ism1A2ATD1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ism1A2ATD1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ism1A2ATD1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ism1A2ATD1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ism1A2ATD1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ism1A2ATD1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ism1A2ATD1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ism1A2ATD1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ism1A2ATD1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ism1A2ATD1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ism1A2ATD1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ism1A2ATD1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ism1A2ATD1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ism1A2ATD1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ism1A2ATD1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ism1A2ATD1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ism1A2ATD1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ism1A2ATD1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ism1A2ATD1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ism1A2ATD1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ism1A2ATD1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ism1A2ATD1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ism1A2ATD1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ism1A2ATD1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ism1A2ATD1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ism1A2ATD1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ism1A2ATD1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ism1A2ATD1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ism1A2ATD1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ism1A2ATD1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ism1A2ATD1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ism1A2ATD1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ism1A2ATD1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ism1A2ATD1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ism1A2ATD1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ism1A2ATD1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ism1A2ATD1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ism1A2ATD1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ism1A2ATD1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ism1A2ATD1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ism1A2ATD1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ism1A2ATD1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ism1A2ATD1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ism1A2ATD1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ism1A2ATD1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ism1A2ATD1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ism1A2ATD1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ism1A2ATD1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ism1A2ATD1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ism1A2ATD1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ism1A2ATD1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ism1A2ATD1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ism1A2ATD1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ism1A2ATD1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ism1A2ATD1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ism1A2ATD1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ism1A2ATD1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ism1A2ATD1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ism1A2ATD1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ism1A2ATD1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ism1A2ATD1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ism1A2ATD1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ism1A2ATD1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ism1A2ATD1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ism1A2ATD1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ism1A2ATD1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ism1A2ATD1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ism1A2ATD1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ism1A2ATD1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ism1A2ATD1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ism1A2ATD1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ism1A2ATD1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ism1A2ATD1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ism1A2ATD1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ism1A2ATD1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ism1A2ATD1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ism1A2ATD1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ism1A2ATD1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ism1A2ATD1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ism1A2ATD1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ism1A2ATD1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ism1A2ATD1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ism1A2ATD1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ism1A2ATD1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ism1A2ATD1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ism1A2ATD1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ism1A2ATD1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ism1A2ATD1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms