Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AgrnA2ASQ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AgrnA2ASQ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AgrnA2ASQ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AgrnA2ASQ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AgrnA2ASQ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AgrnA2ASQ1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AgrnA2ASQ1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AgrnA2ASQ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AgrnA2ASQ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AgrnA2ASQ1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AgrnA2ASQ1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AgrnA2ASQ1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AgrnA2ASQ1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AgrnA2ASQ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AgrnA2ASQ1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AgrnA2ASQ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AgrnA2ASQ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AgrnA2ASQ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AgrnA2ASQ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AgrnA2ASQ1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AgrnA2ASQ1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AgrnA2ASQ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AgrnA2ASQ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AgrnA2ASQ1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AgrnA2ASQ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AgrnA2ASQ1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AgrnA2ASQ1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AgrnA2ASQ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AgrnA2ASQ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AgrnA2ASQ1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AgrnA2ASQ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AgrnA2ASQ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AgrnA2ASQ1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AgrnA2ASQ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AgrnA2ASQ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AgrnA2ASQ1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AgrnA2ASQ1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AgrnA2ASQ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AgrnA2ASQ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AgrnA2ASQ1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AgrnA2ASQ1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AgrnA2ASQ1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AgrnA2ASQ1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AgrnA2ASQ1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AgrnA2ASQ1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AgrnA2ASQ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AgrnA2ASQ1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AgrnA2ASQ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AgrnA2ASQ1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AgrnA2ASQ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AgrnA2ASQ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AgrnA2ASQ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AgrnA2ASQ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AgrnA2ASQ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AgrnA2ASQ1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AgrnA2ASQ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AgrnA2ASQ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AgrnA2ASQ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AgrnA2ASQ1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AgrnA2ASQ1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AgrnA2ASQ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AgrnA2ASQ1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AgrnA2ASQ1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AgrnA2ASQ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AgrnA2ASQ1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AgrnA2ASQ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AgrnA2ASQ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AgrnA2ASQ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AgrnA2ASQ1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AgrnA2ASQ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AgrnA2ASQ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AgrnA2ASQ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AgrnA2ASQ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AgrnA2ASQ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AgrnA2ASQ1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AgrnA2ASQ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AgrnA2ASQ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AgrnA2ASQ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AgrnA2ASQ1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AgrnA2ASQ1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AgrnA2ASQ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AgrnA2ASQ1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AgrnA2ASQ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AgrnA2ASQ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AgrnA2ASQ1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AgrnA2ASQ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AgrnA2ASQ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AgrnA2ASQ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AgrnA2ASQ1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AgrnA2ASQ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AgrnA2ASQ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AgrnA2ASQ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AgrnA2ASQ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AgrnA2ASQ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AgrnA2ASQ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AgrnA2ASQ1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AgrnA2ASQ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AgrnA2ASQ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AgrnA2ASQ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms