Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scn3aA2ASI5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scn3aA2ASI5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Scn3aA2ASI5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Scn3aA2ASI5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Scn3aA2ASI5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Scn3aA2ASI5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Scn3aA2ASI5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Scn3aA2ASI5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Scn3aA2ASI5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scn3aA2ASI5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scn3aA2ASI5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scn3aA2ASI5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scn3aA2ASI5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scn3aA2ASI5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scn3aA2ASI5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scn3aA2ASI5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scn3aA2ASI5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scn3aA2ASI5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Scn3aA2ASI5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scn3aA2ASI5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scn3aA2ASI5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Scn3aA2ASI5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Scn3aA2ASI5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Scn3aA2ASI5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scn3aA2ASI5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scn3aA2ASI5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scn3aA2ASI5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Scn3aA2ASI5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scn3aA2ASI5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scn3aA2ASI5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scn3aA2ASI5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Scn3aA2ASI5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scn3aA2ASI5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scn3aA2ASI5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Scn3aA2ASI5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Scn3aA2ASI5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Scn3aA2ASI5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Scn3aA2ASI5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Scn3aA2ASI5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Scn3aA2ASI5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Scn3aA2ASI5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Scn3aA2ASI5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Scn3aA2ASI5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Scn3aA2ASI5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Scn3aA2ASI5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Scn3aA2ASI5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scn3aA2ASI5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Scn3aA2ASI5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Scn3aA2ASI5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Scn3aA2ASI5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Scn3aA2ASI5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scn3aA2ASI5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scn3aA2ASI5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Scn3aA2ASI5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scn3aA2ASI5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scn3aA2ASI5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scn3aA2ASI5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scn3aA2ASI5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scn3aA2ASI5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Scn3aA2ASI5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scn3aA2ASI5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Scn3aA2ASI5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Scn3aA2ASI5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scn3aA2ASI5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Scn3aA2ASI5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Scn3aA2ASI5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scn3aA2ASI5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scn3aA2ASI5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scn3aA2ASI5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scn3aA2ASI5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scn3aA2ASI5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scn3aA2ASI5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scn3aA2ASI5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scn3aA2ASI5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scn3aA2ASI5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scn3aA2ASI5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Scn3aA2ASI5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Scn3aA2ASI5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scn3aA2ASI5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scn3aA2ASI5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scn3aA2ASI5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scn3aA2ASI5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scn3aA2ASI5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scn3aA2ASI5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Scn3aA2ASI5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scn3aA2ASI5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scn3aA2ASI5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scn3aA2ASI5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scn3aA2ASI5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scn3aA2ASI5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scn3aA2ASI5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scn3aA2ASI5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Scn3aA2ASI5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Scn3aA2ASI5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Scn3aA2ASI5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Scn3aA2ASI5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Scn3aA2ASI5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Scn3aA2ASI5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Scn3aA2ASI5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms