Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4921501E09RikA0A0R4J054 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4921501E09RikA0A0R4J054 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4921501E09RikA0A0R4J054 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4921501E09RikA0A0R4J054 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4921501E09RikA0A0R4J054 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4921501E09RikA0A0R4J054 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4921501E09RikA0A0R4J054 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4921501E09RikA0A0R4J054 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4921501E09RikA0A0R4J054 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
4921501E09RikA0A0R4J054 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
4921501E09RikA0A0R4J054 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4921501E09RikA0A0R4J054 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms