Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FARP1Q9Y4F1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FARP1Q9Y4F1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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