Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP11BQ9Y2G3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP11BQ9Y2G3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms