Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA11Q9UKX5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA11Q9UKX5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms