Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
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