Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD163L1Q9NR16 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms