Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MEPEQ9NQ76 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms