Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC52A2Q9HAB3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC52A2Q9HAB3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC52A2Q9HAB3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC52A2Q9HAB3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC52A2Q9HAB3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC52A2Q9HAB3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC52A2Q9HAB3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC52A2Q9HAB3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC52A2Q9HAB3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC52A2Q9HAB3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC52A2Q9HAB3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC52A2Q9HAB3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC52A2Q9HAB3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms