Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCAS3Q9H6U6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCAS3Q9H6U6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCAS3Q9H6U6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCAS3Q9H6U6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCAS3Q9H6U6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCAS3Q9H6U6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCAS3Q9H6U6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BCAS3Q9H6U6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms