Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms