Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLK3Q9C098 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms