Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SETD2Q9BYW2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SETD2Q9BYW2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms