Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms