Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MKNK1Q9BUB5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKNK1Q9BUB5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms