Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POP1Q99575 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POP1Q99575 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POP1Q99575 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POP1Q99575 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POP1Q99575 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POP1Q99575 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POP1Q99575 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POP1Q99575 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POP1Q99575 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POP1Q99575 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POP1Q99575 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POP1Q99575 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POP1Q99575 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POP1Q99575 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POP1Q99575 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POP1Q99575 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POP1Q99575 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POP1Q99575 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POP1Q99575 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POP1Q99575 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POP1Q99575 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POP1Q99575 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POP1Q99575 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POP1Q99575 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POP1Q99575 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POP1Q99575 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP1Q99575 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP1Q99575 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP1Q99575 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP1Q99575 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP1Q99575 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP1Q99575 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP1Q99575 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POP1Q99575 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP1Q99575 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP1Q99575 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP1Q99575 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP1Q99575 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP1Q99575 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP1Q99575 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP1Q99575 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP1Q99575 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP1Q99575 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP1Q99575 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP1Q99575 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP1Q99575 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP1Q99575 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP1Q99575 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP1Q99575 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP1Q99575 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP1Q99575 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP1Q99575 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP1Q99575 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP1Q99575 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP1Q99575 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP1Q99575 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP1Q99575 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP1Q99575 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP1Q99575 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POP1Q99575 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP1Q99575 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP1Q99575 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP1Q99575 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP1Q99575 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP1Q99575 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP1Q99575 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP1Q99575 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP1Q99575 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP1Q99575 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP1Q99575 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP1Q99575 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP1Q99575 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP1Q99575 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP1Q99575 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP1Q99575 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP1Q99575 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP1Q99575 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP1Q99575 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POP1Q99575 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP1Q99575 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP1Q99575 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP1Q99575 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP1Q99575 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP1Q99575 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP1Q99575 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP1Q99575 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP1Q99575 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP1Q99575 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP1Q99575 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POP1Q99575 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POP1Q99575 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POP1Q99575 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POP1Q99575 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POP1Q99575 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POP1Q99575 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POP1Q99575 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POP1Q99575 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POP1Q99575 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POP1Q99575 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms