Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms