Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LMTK3Q96Q04 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LMTK3Q96Q04 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms