Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDLIM2Q96JY6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms