Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms