Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLX4Q8IY92 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLX4Q8IY92 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms