Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINGO4Q6UY18 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms