Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms