Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms