Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms