Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC30Q5VVM6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC30Q5VVM6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms