Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9C2Q5TAH2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms