Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC158Q5M9N0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms