Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC178Q5BJE1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC178Q5BJE1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms