Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD12Q587J7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms