Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDCA8Q53HL2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms