Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP55Q53EZ4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms