Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms