Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cog7Q3UM29 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms