Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM187BQ17R55 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms