Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NCOA1Q15788 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
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